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Tras los cómputos municipales oficiales, la coalición Morena-PVEM perdió dos municipios y el Partido Verde uno más, respecto a los resultados preliminares del PREP
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Luego de las elecciones del 1 de junio, el Programa de Resultados Electorales Preliminares (PREP) daba a la coalición Morena-PVEM el triunfo en 60 municipios, mientras que Morena y el PVEM, por separado, ganaban 11 y 13 alcaldías, respectivamente. Sin embargo, tras los Cómputos Municipales que iniciaron el miércoles 4 de junio, y con corte a las 16:40 horas del viernes 6, se han realizado 201 cómputos y los resultados cambiaron: la coalición perdió dos municipios y el PVEM uno más, respecto a lo reportado por el PREP.
A diferencia del PREP, los cómputos municipales son el conteo oficial de votos y con ello se puede modificar los resultados preliminares del PREP, ya que se revisan actas, paquetes electorales y se corrigen errores de captura. Por ello, algunos partidos pueden ganar o perder municipios respecto a lo reportado horas después de las elecciones.

